Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cd3dP04235 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd3dP04235 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd3dP04235 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms