Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	RIB4	YOL143C	510 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	THR4	YCR053W	1545 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	TAO3	YIL129C	7131 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	GPI13	YLL031C	3054 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	FKH2	YNL068C	2589 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	IOC4	YMR044W	1428 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YGL193C	YGL193C	312 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	OKP1	YGR179C	1221 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	FOL2	YGR267C	732 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPS21A	YKR057W	264 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	OSW5	YMR148W	447 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YOL035C	YOL035C	303 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	DGA1	YOR245C	1257 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	NAM9	YNL137C	1461 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	VPS33	YLR396C	2076 nt		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPA135	YPR010C	3612 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	TRE2	YOR256C	2430 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	PSF1	YDR013W	627 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	BMH2	YDR099W	822 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	OTU1	YFL044C	906 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPL17A	YKL180W	555 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	MRPL20	YKR085C	588 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	PCD1	YLR151C	1023 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	TPP1	YMR156C	717 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	ALG5	YPL227C	1005 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RSN1	YMR266W	2862 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	HOS2	YGL194C	1359 nt		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	MRH4	YGL064C	1686 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	CSR2	YPR030W	3366 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	ARH1	YDR376W	1482 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	CPR1	YDR155C	489 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	FMP48	YGR052W	1110 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPS23A	YGR118W	438 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YIL025C	YIL025C	375 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	TIP41	YPR040W	1071 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPS23B	YPR132W	438 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	PRP8	YHR165C	7242 nt		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	CCM1	YGR150C	2595 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	LAP2	YNL045W	2016 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	SIZ1	YDR409W	2715 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	MIG1	YGL035C	1515 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	SRC1	YML034W	2505 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YDL162C	YDL162C	357 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RMT2	YDR465C	1239 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	VMA8	YEL051W	771 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YGL214W	YGL214W	486 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	PXR1	YGR280C	816 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	MCM1	YMR043W	861 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	PLP2	YOR281C	861 nt		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RAD7	YJR052W	1698 nt		2.59	□□□□□ -2
VAR1	P02381	ARG5,6	YER069W	2592 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	NUP60	YAR002W	1620 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YPR1	YDR368W	939 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	PET54	YGR222W	882 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YPT35	YHR105W	645 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	OCA2	YNL056W	594 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YOR289W	YOR289W	756 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	SUI3	YPL237W	858 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	MDM38	YOL027C	1722 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	STU2	YLR045C	2667 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YIL092W	YIL092W	1902 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	TGL3	YMR313C	1929 nt		2.58	□□□□□ -2
VAR1	P02381	SMP3	YOR149C	1551 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	UBP12	YJL197W	3765 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	SGN1	YIR001C	753 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	HMX1	YLR205C	954 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	RSF1	YMR030W	1131 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	PEX11	YOL147C	711 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YPL014W	YPL014W	1146 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	NEM1	YHR004C	1341 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	PHO12	YHR215W	1404 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	PHO11	YAR071W	1404 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	MMR1	YLR190W	1476 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	CTR86	YCR054C	1692 nt		2.57	□□□□□ -2
VAR1	P02381	PRR2	YDL214C	2100 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	FLO5	YHR211W	3228 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YDR391C	YDR391C	699 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	RRT7	YLL030C	342 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	EMG1	YLR186W	759 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YBL029W	YBL029W	1131 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	TPM1	YNL079C	600 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	MCK1	YNL307C	1128 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	KRE2	YDR483W	1329 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	BUD4	YJR092W	4344 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	SPS2	YDR522C	1509 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	MIH1	YMR036C	1665 nt		2.56	□□□□□ -2
VAR1	P02381	FRQ1	YDR373W	573 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	URC2	YDR520C	2319 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YGR011W	YGR011W	327 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	SCM4	YGR049W	564 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	YHR202W	YHR202W	1809 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	ECM4	YKR076W	1113 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	PSR1	YLL010C	1284 nt		2.55	□□□□□ -2
VAR1	P02381	SEC65	YML105C	822 nt		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.5 ms