Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD4P01730 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD4P01730 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD4P01730 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD4P01730 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD4P01730 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD4P01730 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD4P01730 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD4P01730 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CD4P01730 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD4P01730 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD4P01730 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD4P01730 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD4P01730 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD4P01730 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD4P01730 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD4P01730 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD4P01730 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD4P01730 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD4P01730 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD4P01730 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD4P01730 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms