Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNA1O75449 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNA1O75449 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNA1O75449 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNA1O75449 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNA1O75449 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNA1O75449 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNA1O75449 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNA1O75449 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNA1O75449 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms