Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pip4k2aO70172 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pip4k2aO70172 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms