Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad51dO55230 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms