Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms