Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk5r2O35926 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms