Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf9O35739 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf9O35739 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms