Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1aO35526 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms