Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700067P10RikG3X8U2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700067P10RikG3X8U2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms