Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdhr2E9Q7P9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdhr2E9Q7P9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms