Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn2r48E9Q5D8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn2r48E9Q5D8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms