Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms