Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm3095E9Q058 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms