Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms