Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21560D3Z7A4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21560D3Z7A4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms