Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DXG7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DXG7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DXG7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DXG7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B4DXG7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B4DXG7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DXG7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
B4DXG7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms