Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpruB1AUH1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpruB1AUH1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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