Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FocadA2AKG8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms