Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms