Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms