Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms