Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc6Q9R087 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc6Q9R087 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc6Q9R087 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc6Q9R087 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236 ms