Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl2Q9QUK0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms