Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNNM1Q9NRU3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM1Q9NRU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms