Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms