Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2l2Q9JLG4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms