Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efcc1Q9JJF6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms