Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6l2Q9JIM3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6l2Q9JIM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms