Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ropn1Q9ESG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms