Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan17Q9D7W4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tspan17Q9D7W4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tspan17Q9D7W4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms