Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms