Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms