Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins3Q9CY94 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins3Q9CY94 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms