Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msmo1Q9CRA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msmo1Q9CRA4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms