Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd1Q9CR42 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ankrd1Q9CR42 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd1Q9CR42 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms