Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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