Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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