Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med4Q9CQA5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med4Q9CQA5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms