Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp3Q9CQ10 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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