Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms