Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epdr1Q99M71 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epdr1Q99M71 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms