Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN3Q96TC7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN3Q96TC7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms