Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP4Q96PP9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms