Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms