Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP36Q96EU6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP36Q96EU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms