Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csmd1Q923L3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms