Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb6Q922F4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms