Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC12Q8WVT3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms